На даний час в університеті проводяться дослідження за такими пріоритетними напрямками:

Фундаментальні дослідження з найважливіших проблем природничих, суспільних і гуманітарних наук

Педагогіка: Історія народної освіти і педагогічної думки в Україні (ХІХ-ХХст.). Модель організації ступеневої підготовки педагогічних кадрів. Удосконалення професійної підготовки сучасного вчителя.
Проблема практичної підготовки майбутнього вчителя до навчально-виховної діяльності в умовах сучасної школи.
Підвищення ролі фізичного виховання у професійній підготовці майбутнього вчителя.
Реалізація міжпредметних зв’язків при вивченні іноземних мов на нефахових факультетах.
Теоретико-методологічні та практичні засади підготовки соціальних педагогів в Україні.
Актуальні питання методики викладання української мови і літератури та культури мовлення у навчальному процесі школи та вузу.
Проблеми викладання зарубіжної літератури в школі і вузі.
Концептуальні засади теорії та методики викладання правознавчих дисциплін у вузі.
Науково-методичні основи професійної підготовки майбутніх учителів музики.
Формування професійної готовності майбутніх учителів музики в процесі інструментально-виконавської підготовки.
Актуальні проблеми професійної підготовки студентів музичного факультету.
Методика навчання іноземних мов на різних освітніх степенях.
Унаочнення навчального процесу з іноземних мов у середніх навчальних закладах.
Сучасні технології підготовки педагогічних працівників за кордоном.
Міждисциплінарні аспекти вивчення і викладання англійської мови.
Теоретичні та практичні аспекти викладання німецької мови як основної.
Вдосконалення змісту і методів викладання математичних дисциплін у педагогічних університетах та загальноосвітніх школах.

Філологія: Мова і стиль письменників Полісся. Комплексне вивчення творчості В. Винниченка: методологічні проблеми, поетика, питання генеології. Мови і стиль творів М.В.Гоголя. Творчість Гоголя у діалозі культур. Література та культура Полісся (Чернігівський регіон).

Історія України та всесвітня історія: Актуальні проблеми трансформації та розвитку історичної науки в Україні. Історико-краєзнавчі старожитності Ніжинщини та Чернігівщини. Проблеми становлення і розвитку сучасних цивілізацій.

Математика: Наближені методи інтегрування диференціальних та інтегральних рівнянь.

Проблеми демографічної політики, розвитку людського потенціалу та формування громадянського суспільства

Філософія та соціологія: Духовні основи суспільства та культуротворчість. Дослідження організації навчально-методичної роботи з циклу економічних та політичних дисциплін для студентів денної та заочної форм навчання.

Збереження навколишнього середовища (довкілля) та сталий розвиток

Історико-фауністичний та еколого-морфологічний аналіз тваринного світу північно-східної України. Рослинність Чернігівщини. Соціально-економічні та екологічні проблеми Чернігівщини.

Новітні біотехнології; діагностика і методи лікування найпоширеніших захворювань

Вивчення рефлексогенних впливів на вісцеральні системи і ВНД людини. Валеологічні аспекти життєвої і учбової діяльності студентської молоді.

Нові комп’ютерні засоби та технології інформатизації суспільства

Запровадження нових освітніх інформаційних технологій.

Нові речовини та матеріали

Синтез нових сульфолановмісних металокомплексів та пошук серед них екологічно безпечних біологічно-активних речовин. Синтез нових сульфолановмісних металокомплексів та пошук серед них нових засобів захисту рослин, біоцидних присадок до нафтопродуктів і фізіологічно-активних речовин. Дослідження плазмон-фононних збуджень у одновісних напівпровідниках та структурах на їх основі.